กองวิเทศสัมพันธ์ ได้รับการจัดตั้งเป็นหน่วยงานระดับกอง ภายใต้สำนักงานอธิการบดี มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ เมื่อวันที่ 30 มีนาคม 2536 ต่อมาในปี 2551 มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ได้ปรับสถานะเป็นมหาวิทยาลัยในกำกับของรัฐ และปรับเปลี่ยนชื่อ “สำนักงานอธิการบดี มหาวิทยาลัยเชียงใหม่” เป็น “สำนักงานมหาวิทยาลัย” ส่งผลให้กองวิเทศสัมพันธ์อยู่ภายใต้การบริหารจัดการของสำนักงานมหาวิทยาลัย

ในปี 2567 มีการปรับโครงสร้างองค์กร โดยเปลี่ยนสถานะกองวิเทศสัมพันธ์เป็น ศูนย์บริหารพันธกิจสากล ตามมติสภามหาวิทยาลัยเชียงใหม่ ครั้งที่ 9/2566 เมื่อวันที่ 23 กันยายน 2566 เพื่อให้การบริหารงานสอดคล้องกับยุทธศาสตร์ความเป็นสากล และตอบสนองต่อการเปลี่ยนแปลงอย่างมีประสิทธิภาพ